趙拾叁在上學途中意外進入新世界，成為了特遣署的一名探員。他發現這個世界居然存在神，但是在二十多年前所有神都離奇失蹤了，少數知情者緘默其口。隨著他的到來，失蹤了二十多年的自由神的下落開始浮出水麵，詭異的碎屍案，再次出現的神印，偷偷豢養的血人，出手襲擊的神秘人……樁樁件件都在指向二十多年前那樁自由神失蹤案，真相逐漸浮出水麵的同時在暗處窺伺的幕後黑手也開始動手。
與此同時，主張絕對自由至上的議會將自由神打成偽神，認為他違背了自由意誌將世界限製在枷鎖裡，在幕後黑手的推波助瀾下想要一舉推翻自由神建立的世界秩序，創造一個絕對自由的新世界，自由神一派的特遣署製衡議會的動作，兩派的鬥爭也愈演愈烈。